Ambas opciones se consideran válidas. Este acrónimo (formado en inglés a partir de COronaVIrus Disease y 2019) se usa normalmente en masculino (el COVID-19) por influjo del género de coronavirus y de otras enfermedades víricas (el zika, el ébola), que toman el nombre del virus que las causa. No obstante, el uso en femenino (la COVID-19) —como el de la OMS en sus páginas en español— está justificado por ser el nombre femenino enfermedad (disease en inglés) el núcleo del acrónimo.
¿Se escribe «COVID-19» o «covid-19»?Al ser un acrónimo de reciente creación aún no lexicalizado, lo indicado es su escritura en mayúsculas (COVID-19), pero, si se convierte plenamente en el nombre común de la enfermedad, pasaría a escribirse covid-19 (no Covid-19) o simplemente covid.